Sample Set Annotation Tool: Uppsala and Singapore dataset

Study Design
Assay
Sample Info
Files
Info
Samples
Group Sets
Analysis

Purpose

The aim of this study was to define a gene expression signature capable of discerning breast tumors of grade 1 (G1) and grade 3 (G3) histology which might provide a more objective measure of grade with prognostic benefit for patients with G2 disease.

Hypothesis

The hypothesis of this study is that a gene expression signature capable of discriminating low- and high-grade tumors might provide a more objective and clinically valuable measure of tumor grade with prognostic significance for patients with moderately differentiated cancer.

Experimental Design

This dataset consists of two breast cancer cohorts: Uppsala (n=249) and Singapore (n=40).

The Uppsala cohort originally composed of 315 women representing 65% of all breast cancers resected in Uppsala County, Sweden, from January 1, 1987, to December 31, 1989. All sections were graded in a blinded fashion (H.N.) according to the Nottingham Grading System as described by Elston et al. The Uppsala tumor samples were approved for microarray profiling by the ethical committee at the Karolinska Institute, Stockholm, Sweden.

The Singapore samples were derived from patients operated on at the National University Hospital (Singapore) from February 1, 2000, through January 31, 2002. Routine clinical data were obtained from pathology reports, but no information on recurrence or cause of death was available. Tumor sections were graded by T.C.P. according to the Nottingham grading system as applied to the Uppsala cohort, with the following exception: Mitotic Index: 1 = low, if <8 mitoses; 2 = medium, if 9 to 16 mitoses; and 3 = high, if >16 mitoses (per 10 high-power fields); field diameter was 0.55 mm. Only histologic G2 samples were evaluated in this study. The Singapore samples were approved for microarray profiling by the Singapore National University Hospital ethics board.

Experimental Variables

Controls

Methods

All tumor samples were profiled on the Affymetrix U133A&B genechips. Microarray analysis of the Uppsala and Singapore samples was carried out at the Genome Institute of Singapore. All data were normalized using the global mean method (MAS5), and probe set signal intensities were natural log transformed and scaled by adjusting the mean signal to a target value of log 500.

Additional Information

Ivshina, Anna V., Joshy George, Oleg Senko, Benjamin Mow, Thomas C. Putti, Johanna Smeds, Thomas Lindahl, et al. “Genetic Reclassification of Histologic Grade Delineates New Clinical Subtypes of Breast Cancer.” Cancer Research 66, no. 21 (November 1, 2006): 10292–301. doi:10.1158/0008-5472.CAN-05-4414.

Elston, C. W., and I. O. Ellis. “Pathological Prognostic Factors in Breast Cancer. I. The Value of Histological Grade in Breast Cancer: Experience from a Large Study with Long-Term Follow-Up.” Histopathology 41, no. 3A (September 2002): 154–61.

Expected Samples:

289 Samples Loaded: 289

Species

Human (Homo sapiens)

Sample Source

National University Hospital, Singapore , Nagalla 2013 , Breast Cancer Tissue , Uppsala University Hospital , Uppsala, Sweden

Disease

Mixed Breast Cancer Types

Treatment Protocol

Growth Protocol

Extraction Protocol

Storage Conditions

Sample Set Spreadsheet

Please log in in order to upload files.

Samples Preview

Sample ID	series	IMS	IBS	IDS	ICR
GSM110874	NA	Normal	IBE	NA	ICR2
GSM110875	NA	NA	NA	NA	NA
GSM110876	NA	Her2	IBE	WID	ICR3
GSM110877	NA	Basal	IBE	FID	ICR4
GSM110878	NA	LumB	IBE	WID	ICR3

Please log in in order to upload files.

File
GSE4922.GPL97_appended.meta.data_v1.csv Sample Set Spreadsheet

Samples Viewer / Editor

All fields are editable except the "Sample ID" column. To edit a cell, click within the cell. To edit a "date" cell, click on the calendar icon. To cancel an edit, press the ESC key.

Sample ID	Series	IMS	IBS	IDS	ICR	Array Sample ID	Sample Title	DMFS 10Y EVENT	DMFS 10Y TIME	Disease Free Survival Event	Distant Met Free Survival Event	Distant Met Free Survival	Age At Initial Pathologic Diagnosis	Lymph Node Status	ER Status	PR Status	Histology Differentiation Grade	Tumor Size Cm	Pathology T Stage	Disease Free Survival Years	Sample Title2	ER Endocrine Therapy Only 1=included In Survival Analysis	Histology Differention Grade	Genetic Grade Signature Status Sws Classifier	No Systemic Therapy 1=included In Survival Analysis	Probability1 By Sws Classifier	Probability3 By Sws Classifier	P53 Mutation Status
GSM110874	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004047	B X100B08	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	68	LN-	ER+	NA	NA	0.9	T1b	11.83333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110875	NA	NA	NA	NA	NA	400004048	B X101B88	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	40	LN-	ER-	NA	NA	1.2	T1c	11.83333333	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM110876	NA	Her2	IBE	WID	ICR3	400004049	B X102B06	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	51	LN-	ER+	NA	NA	2.6	T2	11.83333333	NA	NA	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM110877	NA	Basal	IBE	FID	ICR4	400004050	B X103B41	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	52	LN+	ER-	NA	NA	2.2	T2	11.75	NA	NA	G3	3-like	NA	0.004712747	0.995287253	p53-
GSM110878	NA	LumB	IBE	WID	ICR3	400004051	B X104B91	DistantMetastasisFree	3.58	DiseaseFree	NA	NA	80	NA	ER+	NA	NA	2.4	T2	3.58333333	NA	1	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM110879	NA	Normal	IBE	NA	ICR1	400004052	B X105B13	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	46	LN-	ER+	NA	NA	1.3	T1c	11.75	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110880	NA	Normal	IBE	NA	ICR1	400004053	B X106B55	DistantMetastasis	6.92	Recurred/Progressed	NA	NA	37	LN-	ER+	NA	NA	6	T3/T4	1.16666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110881	NA	LumB	IBD	PID	ICR2	400004054	B X10B88	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	70	LN-	ER+	NA	NA	5	T2	11.33333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110882	NA	Basal	IBE	PID	ICR1	400004055	B X110B34	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	74	LN-	ER+	NA	NA	2	T1c	11.66666667	NA	NA	G2	2b	1	0.000680426	0.999319574	p53+
GSM110883	NA	Her2	IBE	PID	ICR2	400004056	B X111B51	DistantMetastasis	0.5	Recurred/Progressed	NA	NA	41	LN-	ER+	NA	NA	3.3	T2	0.5	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM110884	NA	LumB	IBD	PID	ICR3	400004057	B X112B55	DistantMetastasis	0.92	Recurred/Progressed	NA	NA	61	LN+	ER+	NA	NA	2.4	T2	0.91666667	NA	1	G2	2b	NA	0.0063593	0.9936407	p53-
GSM110885	NA	Her2	IBE	PID	ICR1	400004058	B X113B11	DistantMetastasis	3.08	Recurred/Progressed	NA	NA	38	LN-	ER+	NA	NA	3.2	T2	3.08333333	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53-
GSM110886	NA	LumB	IBD	PID	ICR2	400004059	B X114B68	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	67	LN+	ER+	NA	NA	1.2	T1c	11.16666667	NA	1	G1	1-like	NA	0.733007209	0.266992791	p53-
GSM110887	NA	LumA	IBD	PID	ICR2	400004060	B X11B47	DistantMetastasisFree	7.42	DiseaseFree	NA	NA	69	LN-	ER-	NA	NA	1.8	T1c	7.41666667	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110888	NA	Her2	IBE	PID	ICR2	400004061	B X120B73	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	34	LN-	ER+	NA	NA	1.6	T1c	11.58333333	NA	NA	G2	2b	1	0.000680426	0.999319574	p53-
GSM110889	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004062	B X122B81	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	79	LN-	ER+	NA	NA	1.9	T1c	11.16666667	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110890	NA	LumA	IBD	WID	ICR3	400004063	B X124B25	DistantMetastasis	5	Recurred/Progressed	NA	NA	46	LN-	ER+	NA	NA	2.1	T2	5	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110891	NA	Her2	IBE	WID	ICR4	400004064	B X127B00	DistantMetastasis	1.92	Recurred/Progressed	NA	NA	57	LN-	ER+	NA	NA	2.2	T2	1.91666667	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM110892	NA	LumA	IBD	WID	ICR2	400004065	B X128B48	DistantMetastasisFree	4.58	DiseaseFree	NA	NA	71	NA	Unknown	NA	NA	1.2	T1c	4.58333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110893	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004066	B X130B92	DistantMetastasis	4.42	Recurred/Progressed	NA	NA	73	LN+	ER+	NA	NA	1.8	T1c	4.41666667	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110894	NA	LumB	IBD	WID	ICR3	400004067	B X131B79	DistantMetastasis	1.75	Recurred/Progressed	NA	NA	59	LN+	ER+	NA	NA	2.6	T2	1.75	NA	1	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53-
GSM110895	NA	LumB	IBE	WID	ICR4	400004068	B X134B33	DistantMetastasis	2	Recurred/Progressed	NA	NA	63	LN-	ER+	NA	NA	2.8	T2	2	NA	NA	G2	2b	1	0.014555379	0.985444621	p53-
GSM110896	NA	LumA	IBD	WID	ICR2	400004069	B X135B40	DistantMetastasis	9.5	Recurred/Progressed	NA	NA	64	LN-	ER+	NA	NA	2.6	T2	9.5	NA	1	G1	1-like	NA	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110897	NA	NA	NA	NA	NA	400004070	B X136B04	NA	NA	Recurred/Progressed	NA	NA	54	LN-	ER+	NA	NA	1.7	T1c	2.41666667	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110898	NA	Her2	IBD	FID	ICR4	400004071	B X137B88	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	68	LN-	ER-	NA	NA	0.6	T1b	10.5	NA	NA	G2	2a	1	0.893983567	0.106016433	p53+
GSM110899	NA	LumA	IBD	PID	ICR2	400004072	B X138B34	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	65	LN+	ER+	NA	NA	2.3	T2	11.5	NA	1	G1	1-like	NA	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110900	NA	LumB	IBE	PID	ICR1	400004073	B X139B03	DistantMetastasis	0.33	Recurred/Progressed	NA	NA	84	LN-	ER+	NA	NA	2.8	T2	0.33333333	NA	1	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53-
GSM110901	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004074	B X13B79	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	67	LN-	ER+	NA	NA	2.5	T2	10.83333333	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110902	NA	LumA	IBD	WID	ICR2	400004075	B X140B91	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	61	LN-	ER+	NA	NA	1.2	T1c	11.5	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110903	NA	Her2	IBE	FID	ICR3	400004076	B X142B05	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	67	LN-	ER-	NA	NA	2.7	T2	1.25	NA	NA	G3	3-like	1	0.022706835	0.977293165	p53-
GSM110904	NA	Her2	IBE	PID	ICR3	400004077	B X143B81	DistantMetastasisFree	2.17	DiseaseFree	NA	NA	93	NA	ER-	NA	NA	2.9	T2	2.16666667	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM110905	NA	NA	NA	NA	NA	400004078	B X144B49	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	40	LN-	ER+	NA	NA	2.1	T2	11.5	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53+
GSM110906	NA	Basal	IBE	FID	ICR4	400004079	B X145B10	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	73	LN-	ER+	NA	NA	1.8	T1c	11.41666667	NA	NA	G2	2b	1	0.003404448	0.996595552	p53-
GSM110907	NA	Basal	IBE	WID	ICR3	400004080	B X146B39	DistantMetastasisFree	0.67	DiseaseFree	NA	NA	34	LN+	ER-	NA	NA	5	T2	0.66666667	NA	NA	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM110908	NA	Her2	IBE	FID	ICR3	400004081	B X147B19	DistantMetastasisFree	5.08	Recurred/Progressed	NA	NA	71	LN+	ER-	NA	NA	2.4	T2	1.83333333	NA	NA	G3	3-like	NA	0.003813369	0.996186631	p53+
GSM110909	NA	LumA	IBD	WID	ICR2	400004082	B X14B98	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	61	LN+	ER+	NA	NA	2	T1c	10.83333333	NA	1	G2	2a	NA	0.923568575	0.076431425	p53-
GSM110910	NA	Her2	IBD	PID	ICR2	400004083	B X150B81	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	55	LN+	ER+	NA	NA	3.5	T2	11.41666667	NA	1	G2	2a	NA	0.776189238	0.223810762	p53-
GSM110911	NA	LumA	IBD	PID	ICR2	400004084	B X151B84	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	57	LN-	ER+	NA	NA	1.5	T1c	11.41666667	NA	NA	G2	2a	1	0.893983567	0.106016433	p53-
GSM110912	NA	LumB	IBD	PID	ICR2	400004085	B X152B99	DistantMetastasisFree	2.08	DiseaseFree	NA	NA	83	LN-	ER+	NA	NA	1.8	T1c	2.08333333	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110913	NA	Basal	IBE	PID	ICR2	400004086	B X153B09	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	71	LN-	ER-	NA	NA	1.8	T1c	11.41666667	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM110914	NA	LumB	IBE	PID	ICR2	400004087	B X154B42	DistantMetastasis	3.42	Recurred/Progressed	NA	NA	52	LN+	ER+	NA	NA	0.9	T1b	3.41666667	NA	1	G2	2b	NA	0.004539265	0.995460735	p53-
GSM110915	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004088	B X155B52	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	57	LN-	ER-	NA	NA	1.3	T1c	11.41666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110916	NA	Normal	IBE	NA	ICR1	400004089	B X156B01	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	70	LN-	ER+	NA	NA	1.2	T1c	0.83333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110917	NA	Normal	IBE	NA	ICR3	400004090	B X158B84	DistantMetastasisFree	8.5	Recurred/Progressed	NA	NA	69	LN-	ER+	NA	NA	0.7	T1b	4.66666667	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110918	NA	LumB	IBE	WID	ICR3	400004091	B X159B47	DistantMetastasis	6.5	Recurred/Progressed	NA	NA	57	LN+	ER+	NA	NA	1.4	T1c	6.5	NA	1	G2	2b	NA	0.000680426	0.999319574	p53+
GSM110919	NA	LumA	IBD	WID	ICR2	400004092	B X15C94	DistantMetastasisFree	4.42	DiseaseFree	NA	NA	83	LN-	ER+	NA	NA	5	T2	4.41666667	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110920	NA	LumA	IBD	WID	ICR3	400004093	B X160B16	DistantMetastasisFree	5.5	DiseaseFree	NA	NA	73	LN-	ER+	NA	NA	1.4	T1c	5.5	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110921	NA	LumA	IBD	PID	ICR3	400004094	B X161B31	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	69	LN-	ER+	NA	NA	1.3	T1c	11.41666667	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110922	NA	LumB	IBD	PID	ICR2	400004095	B X162B98	DistantMetastasis	8.92	Recurred/Progressed	NA	NA	73	LN+	ER+	NA	NA	3.3	T2	8.91666667	NA	1	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53-
GSM110923	NA	LumA	IBD	WID	ICR2	400004096	B X163B27	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	49	LN-	ER+	NA	NA	0.8	T1b	11.33333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110924	NA	Her2	IBE	WID	ICR3	400004097	B X164B81	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	62	LN-	ER-	NA	NA	2.3	T2	11.33333333	NA	NA	G2	2b	1	0.000680426	0.999319574	p53+
GSM110925	NA	LumB	IBD	FID	ICR3	400004098	B X165B72	DistantMetastasis	1.5	Recurred/Progressed	NA	NA	74	LN+	ER+	NA	NA	2.3	T2	1.5	NA	1	G2	2b	NA	0.045745654	0.954254346	p53-
GSM110926	NA	LumB	IBD	WID	ICR2	400004099	B X166B79	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	65	LN+	ER+	NA	NA	2.2	T2	11.33333333	NA	1	G2	2b	NA	0.024840474	0.975159526	p53-
GSM110927	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004100	B X168B51	DistantMetastasisFree	5.33	DiseaseFree	NA	NA	90	LN-	ER+	NA	NA	4.5	T2	5.33333333	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110928	NA	NA	IBE	NA	ICR2	400004101	B X169B79	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	57	LN-	ER+	NA	NA	1.411	T1c	11.33333333	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110929	NA	LumA	IBD	PID	ICR2	400004102	B X16C97	DistantMetastasis	3.58	Recurred/Progressed	NA	NA	80	LN-	ER+	NA	NA	1.5	T1c	3.58333333	NA	NA	G2	2a	1	0.876553	0.123447	p53-
GSM110930	NA	LumA	IBD	PID	ICR2	400004103	B X170B15	DistantMetastasis	4.08	Recurred/Progressed	NA	NA	70	LN+	ER+	NA	NA	2.5	T2	4.08333333	NA	1	G2	2a	NA	0.893983567	0.106016433	p53-
GSM110931	NA	Her2	IBE	PID	ICR2	400004104	B X171B77	DistantMetastasis	7	Recurred/Progressed	NA	NA	62	LN-	ER+	NA	NA	1.8	T1c	1.75	NA	1	G2	2b	NA	0.004539265	0.995460735	p53-
GSM110932	NA	Her2	IBE	FID	ICR4	400004105	B X172B19	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	42	LN-	ER+	NA	NA	2.3	T2	8.58333333	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53-
GSM110933	NA	LumA	IBD	WID	ICR2	400004106	B X173B43	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	72	LN+	ER+	NA	NA	1.6	T1c	11.25	NA	1	G1	1-like	NA	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110934	NA	Normal	IBE	NA	ICR1	400004107	B X174B41	DistantMetastasis	3.33	Recurred/Progressed	NA	NA	74	LN-	ER+	NA	NA	1.1	T1c	3.33333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110935	NA	Her2	IBD	PID	ICR2	400004108	B X175B72	DistantMetastasis	0.001	Recurred/Progressed	NA	NA	46	LN+	ER+	NA	NA	6	T3/T4	0	NA	NA	G2	2a	NA	0.893983567	0.106016433	p53-
GSM110936	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004109	B X176B74	DistantMetastasisFree	6	DiseaseFree	NA	NA	77	LN-	ER+	NA	NA	2.5	T2	6	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110937	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004110	B X177B67	DistantMetastasis	6.83	Recurred/Progressed	NA	NA	41	LN-	ER+	NA	NA	1.8	T1c	6.83333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110938	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004111	B X178B74	DistantMetastasisFree	7.42	DiseaseFree	NA	NA	82	LN-	ER+	NA	NA	1.6	T1c	7.41666667	NA	NA	G2	2a	1	0.759854772	0.240145228	p53-
GSM110939	NA	Her2	IBD	PID	ICR1	400004112	B X179B28	DistantMetastasis	2.33	Recurred/Progressed	NA	NA	66	LN-	ER+	NA	NA	0.8	T1b	2.33333333	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110940	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004113	B X17C40	DistantMetastasisFree	1.92	DiseaseFree	NA	NA	83	NA	ER+	NA	NA	2.5	T2	1.91666667	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110941	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004114	B X180B38	DistantMetastasisFree	7.25	DiseaseFree	NA	NA	70	LN-	ER+	NA	NA	0.2	T1a	7.25	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110942	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004115	B X181B70	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	34	LN+	ER+	NA	NA	2	T1c	1.91666667	NA	NA	G1	1-like	NA	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110943	NA	Basal	IBE	FID	ICR4	400004116	B X182B43	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	51	LN+	ER-	NA	NA	2.8	T2	11.08333333	NA	NA	G3	3-like	NA	0.004489338	0.995510662	p53-
GSM110944	NA	LumB	IBD	PID	ICR1	400004117	B X183B75	DistantMetastasis	7	Recurred/Progressed	NA	NA	60	LN+	ER+	NA	NA	2.4	T2	7	NA	1	G2	2a	NA	0.893983567	0.106016433	p53-
GSM110945	NA	Normal	IBE	NA	ICR3	400004118	B X184B38	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	63	LN-	ER+	NA	NA	1	T1b	11	NA	NA	G1	1-like	1	0.886663152	0.113336848	p53-
GSM110946	NA	Normal	IBE	NA	ICR3	400004119	B X185B44	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	68	LN-	ER+	NA	NA	0.8	T1b	11	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110947	NA	LumB	IBD	PID	ICR2	400004120	B X186B22	DistantMetastasis	0.17	Recurred/Progressed	NA	NA	86	LN+	ER+	NA	NA	4.6	T2	0.16666667	NA	1	G2	2b	NA	0.02872777	0.97127223	p53+
GSM110948	NA	NA	NA	NA	NA	400004121	B X187B36	NA	NA	Recurred/Progressed	NA	NA	29	LN+	ER+	NA	NA	2.3	T2	0	NA	NA	G2	2b	NA	0.000680426	0.999319574	p53+
GSM110949	NA	Her2	IBD	FID	ICR4	400004122	B X188B13	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	60	LN-	ER-	NA	NA	1.4	T1c	11	NA	NA	G2	2b	1	0.466567974	0.533432026	p53-
GSM110950	NA	Her2	IBE	FID	ICR4	400004123	B X189B83	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	58	LN-	ER-	NA	NA	3.8	T2	11	NA	NA	G2	2b	NA	0.004539265	0.995460735	p53+
GSM110951	NA	LumB	IBD	PID	ICR2	400004124	B X18C56	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	68	LN-	ER+	NA	NA	1.9	T1c	10.75	NA	NA	G2	2a	1	0.776189238	0.223810762	p53-
GSM110952	NA	Her2	IBE	WID	ICR3	400004125	B X191B79	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	59	LN-	ER+	NA	NA	2.7	T2	4.41666667	NA	1	G2	2b	NA	0.000680426	0.999319574	p53-
GSM110953	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004126	B X192B69	DistantMetastasisFree	7.92	DiseaseFree	NA	NA	73	LN-	ER+	NA	NA	0.8	T1b	7.91666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110954	NA	ClaudinLow	IBD	FID	ICR4	400004127	B X193B72	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	68	LN+	ER-	NA	NA	1.6	T1c	10.91666667	NA	NA	G2	2b	NA	0.466567974	0.533432026	p53-
GSM110955	NA	Her2	IBE	WID	ICR3	400004128	B X194B60	DistantMetastasisFree	3.58	DiseaseFree	NA	NA	77	LN+	ER+	NA	NA	2.2	T2	3.58333333	NA	1	G3	3-like	NA	0.004712747	0.995287253	p53+
GSM110956	NA	LumB	IBD	PID	ICR2	400004129	B X195B75	DistantMetastasisFree	3	DiseaseFree	NA	NA	87	LN-	ER+	NA	NA	1.8	T1c	3	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110957	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004130	B X196B81	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	65	LN-	ER+	NA	NA	1.4	T1c	10.91666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110958	NA	NA	NA	NA	NA	400004131	B X197B95	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	44	LN-	ER+	NA	NA	1.6	T1c	10.91666667	NA	NA	G2	2a	1	0.776189238	0.223810762	p53-
GSM110959	NA	LumA	IBD	WID	ICR2	400004132	B X198B90	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	74	LN-	ER+	NA	NA	2	T1c	10.91666667	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110960	NA	NA	NA	NA	NA	400004133	B X199B55	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	54	LN-	ER+	NA	NA	2.3	T2	10.91666667	NA	NA	G2	2a	1	0.893983567	0.106016433	p53-
GSM110961	NA	NA	NA	NA	NA	400004134	B X19C33	NA	NA	Recurred/Progressed	NA	NA	61	LN+	ER+	NA	NA	3.1	T2	0	NA	NA	G1	1-like	NA	0.959265176	0.040734824	p53+
GSM110962	NA	LumA	IBD	WID	ICR3	400004135	B X200B47	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	47	LN+	ER+	NA	NA	2	T1c	5.41666667	NA	NA	G3	1-like	NA	0.930775423	0.069224577	p53-
GSM110963	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004136	B X201B68	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	53	LN+	ER+	NA	NA	2.4	T2	10.91666667	NA	NA	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110964	NA	ClaudinLow	IBD	WID	ICR2	400004137	B X202B44	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	72	LN-	ER+	NA	NA	1	T1b	10.83333333	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110965	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004138	B X203B49	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	51	LN+	ER+	NA	NA	4	T2	10.83333333	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110966	NA	LumA	IBD	WID	ICR3	400004139	B X204B85	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	70	LN-	ER+	NA	NA	1.2	T1c	10.58333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.914572864	0.085427136	p53-
GSM110967	NA	NA	IBE	NA	ICR1	400004140	B X205B99	DistantMetastasis	4.42	Recurred/Progressed	NA	NA	59	LN-	ER+	NA	NA	2.2	T2	4.41666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110968	NA	LumB	IBD	PID	ICR2	400004141	B X206C05	DistantMetastasisFree	6.42	DiseaseFree	NA	NA	80	LN-	ER+	NA	NA	1.8	T1c	6.41666667	NA	NA	G2	2a	1	0.923568575	0.076431425	p53-
GSM110969	NA	LumA	IBD	PID	ICR2	400004142	B X207C08	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	59	LN+	ER+	NA	NA	1	T1b	10.83333333	NA	1	G1	1-like	NA	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110970	NA	LumB	IBE	PID	ICR1	400004143	B X208C06	DistantMetastasisFree	0.08	DiseaseFree	NA	NA	67	NA	ER+	NA	NA	2.2	T2	0.08333333	NA	NA	G2	2b	NA	0.000680426	0.999319574	p53+
GSM110971	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004144	B X209C10	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	80	LN-	ER+	NA	NA	1.4	T1c	10.83333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110972	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004145	B X210C72	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	45	LN-	ER+	NA	NA	4.2	T2	0.5	NA	NA	G2	2a	NA	0.893983567	0.106016433	p53-
GSM110973	NA	LumB	IBD	PID	ICR1	400004146	B X211C88	DistantMetastasisFree	1.5	DiseaseFree	NA	NA	85	NA	ER+	NA	NA	1.8	T1c	1.5	NA	NA	G2	2a	1	0.776189238	0.223810762	p53-
GSM110974	NA	LumA	IBD	WID	ICR2	400004147	B X212C21	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	74	LN-	Unknown	NA	NA	2.414	T2	3.75	NA	NA	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110975	NA	Basal	IBE	FID	ICR4	400004148	B X213C36	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	70	LN-	ER+	NA	NA	1.8	T1c	10.08333333	NA	NA	G2	2b	1	0.004539265	0.995460735	p53+
GSM110976	NA	Her2	IBD	FID	ICR3	400004149	B X216C61	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	71	LN+	ER+	NA	NA	2.2	T2	10.75	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110977	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004150	B X217C79	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	74	LN-	ER+	NA	NA	1.9	T1c	10.75	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110978	NA	LumB	IBD	PID	ICR2	400004151	B X218C29	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	69	LN-	ER+	NA	NA	1.4	T1c	10.75	NA	NA	G2	2a	1	0.893983567	0.106016433	p53-
GSM110979	NA	LumA	IBD	WID	ICR1	400004152	B X21C28	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	68	LN-	ER+	NA	NA	1	T1b	10.66666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110980	NA	NA	NA	NA	NA	400004153	B X220C70	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	42	LN-	ER+	NA	NA	2	T1c	10.75	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110981	NA	Basal	IBE	FID	ICR4	400004154	B X221C14	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	68	LN-	ER+	NA	NA	1.7	T1c	3	NA	NA	G2	2b	1	0.141094296	0.858905704	p53-
GSM110982	NA	LumB	IBD	PID	ICR1	400004155	B X222C26	DistantMetastasis	0.08	Recurred/Progressed	NA	NA	50	LN+	ER+	NA	NA	6.5	T3/T4	0.08333333	NA	NA	G3	3-like	NA	0.025865947	0.974134053	p53+
GSM110983	NA	Normal	IBE	NA	ICR1	400004156	B X223C51	DistantMetastasisFree	8.42	DiseaseFree	NA	NA	44	LN+	ER+	NA	NA	3.2	T2	8.41666667	NA	NA	G2	2a	NA	0.893983567	0.106016433	p53-
GSM110984	NA	Basal	IBD	FID	ICR2	400004157	B X224C93	DistantMetastasisFree	7.92	DiseaseFree	NA	NA	70	LN-	ER-	NA	NA	1.1	T1c	7.91666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110985	NA	LumB	IBE	WID	ICR3	400004158	B X225C52	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	72	LN+	ER+	NA	NA	2.7	T2	10.75	NA	1	G2	2b	NA	0.000680426	0.999319574	p53-
GSM110986	NA	Basal	IBE	FID	ICR4	400004159	B X226C06	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	28	LN+	ER+	NA	NA	4.5	T2	10.75	NA	NA	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM110987	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004160	B X227C50	DistantMetastasisFree	9.08	DiseaseFree	NA	NA	57	LN-	ER+	NA	NA	1.2	T1c	9.08333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110988	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004161	B X229C44	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	52	LN-	ER+	NA	NA	1.3	T1c	10.66666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110989	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004162	B X22C62	DistantMetastasisFree	4.83	DiseaseFree	NA	NA	83	LN-	ER+	NA	NA	1.2	T1c	4.83333333	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM110990	NA	Her2	IBE	PID	ICR1	400004163	B X230C47	DistantMetastasis	0.5	Recurred/Progressed	NA	NA	77	LN+	ER+	NA	NA	2.2	T2	0.5	NA	1	G2	2b	NA	0.000680426	0.999319574	p53-
GSM110991	NA	NA	NA	NA	NA	400004164	B X231C80	NA	NA	Recurred/Progressed	NA	NA	56	LN-	ER+	NA	NA	2.2	T2	6.41666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110992	NA	Her2	IBE	PID	ICR3	400004165	B X232C58	DistantMetastasis	1.75	Recurred/Progressed	NA	NA	44	LN+	ER+	NA	NA	2.4	T2	1.75	NA	NA	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53-
GSM110993	NA	Normal	IBE	NA	ICR3	400004166	B X233C91	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	49	LN-	ER+	NA	NA	1.1	T1c	10.66666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110994	NA	Basal	IBE	WID	ICR3	400004167	B X234C15	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	29	LN+	ER+	NA	NA	1.1	T1c	10.66666667	NA	NA	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53-
GSM110995	NA	LumB	IBE	FID	ICR4	400004168	B X235C20	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	71	LN-	Unknown	NA	NA	2.1	T2	10.66666667	NA	NA	G1	1-like	NA	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110996	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004169	B X236C55	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	72	LN-	ER+	NA	NA	1.8	T1c	10.66666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM110997	NA	Her2	IBE	FID	ICR3	400004170	B X237C56	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	50	LN+	ER+	NA	NA	1.9	T1c	10.66666667	NA	NA	G2	2b	NA	0.141094296	0.858905704	p53-
GSM110998	NA	Her2	IBD	WID	ICR3	400004171	B X238C87	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	54	LN-	ER-	NA	NA	2.4	T2	10.66666667	NA	NA	G3	1-like	NA	0.595003785	0.404996215	p53-
GSM110999	NA	LumB	IBE	WID	ICR3	400004172	B X23C52	DistantMetastasis	8.5	Recurred/Progressed	NA	NA	68	LN-	ER+	NA	NA	2.2	T2	8.5	NA	NA	G2	2b	1	0.004539265	0.995460735	p53+
GSM111000	NA	LumB	IBD	FID	ICR4	400004173	B X240C54	DistantMetastasis	2.42	Recurred/Progressed	NA	NA	61	LN+	ER+	NA	NA	3.5	T2	2.41666667	NA	NA	G2	2b	1	0.004539265	0.995460735	p53+
GSM111001	NA	LumB	IBE	PID	ICR1	400004174	B X241C01	DistantMetastasis	6.75	Recurred/Progressed	NA	NA	66	LN-	ER+	NA	NA	2.3	T2	0.91666667	NA	NA	G3	3-like	1	0.046564195	0.953435805	p53-
GSM111002	NA	LumB	IBE	WID	ICR3	400004175	B X242C21	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	64	LN-	ER+	NA	NA	1.8	T1c	2.16666667	NA	NA	G2	2b	1	0.20815653	0.79184347	p53+
GSM111003	NA	Normal	IBE	NA	ICR1	400004176	B X243C70	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	50	LN-	ER+	NA	NA	1	T1b	10.58333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111004	NA	LumB	IBE	PID	ICR1	400004177	B X244C89	DistantMetastasis	7.25	Recurred/Progressed	NA	NA	51	LN+	ER+	NA	NA	3.3	T2	7.25	NA	1	G2	2a	NA	0.776189238	0.223810762	p53-
GSM111005	NA	Basal	IBE	PID	ICR4	400004178	B X245C22	DistantMetastasis	0.001	Recurred/Progressed	NA	NA	76	LN+	ER+	NA	NA	4.5	T2	0	NA	1	G2	2b	NA	0.141094296	0.858905704	p53+
GSM111006	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004179	B X246C75	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	73	LN-	ER+	NA	NA	1.1	T1c	10.16666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.886663152	0.113336848	p53-
GSM111007	NA	NA	NA	NA	NA	400004180	B X247C76	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	56	LN-	ER+	NA	NA	2.5	T2	10.5	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111008	NA	NA	NA	NA	NA	400004181	B X248C91	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	57	LN-	ER+	NA	NA	2.3	T2	10.5	NA	NA	G1	3-like	1	0.485629336	0.514370664	p53-
GSM111009	NA	Basal	IBE	WID	ICR3	400004182	B X249C42	DistantMetastasisFree	0.17	DiseaseFree	NA	NA	88	NA	ER-	NA	NA	2.5	T2	0.16666667	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53-
GSM111010	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004183	B X24C30	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	55	LN-	ER+	NA	NA	1.6	T1c	10.66666667	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111011	NA	Basal	IBE	FID	ICR3	400004184	B X250C78	DistantMetastasis	2.5	Recurred/Progressed	NA	NA	75	LN-	ER-	NA	NA	1.8	T1c	2.5	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM111012	NA	Normal	IBE	NA	ICR3	400004185	B X251C14	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	66	LN-	ER+	NA	NA	0.8	T1b	10.5	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111013	NA	Basal	IBE	FID	ICR4	400004186	B X252C64	DistantMetastasis	3.08	Recurred/Progressed	NA	NA	77	LN-	ER+	NA	NA	2.525	T2	3.08333333	NA	1	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53-
GSM111014	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004187	B X253C20	DistantMetastasisFree	8	Recurred/Progressed	NA	NA	75	LN-	ER+	NA	NA	0.9	T1b	2.16666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111015	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004188	B X254C80	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	67	LN-	ER+	NA	NA	2.2	T2	10.5	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111016	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004189	B X255C06	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	72	LN-	ER+	NA	NA	2.2	T2	10.5	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111017	NA	Her2	IBE	PID	ICR1	400004190	B X256C45	DistantMetastasis	1.25	Recurred/Progressed	NA	NA	57	LN+	ER-	NA	NA	3.2	T2	1.25	NA	NA	G2	2b	NA	0.000680426	0.999319574	p53+
GSM111018	NA	LumA	IBD	WID	ICR3	400004191	B X257C87	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	46	LN+	ER+	NA	NA	2	T1c	10.5	NA	NA	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111019	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004192	B X258C21	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	71	LN-	ER+	NA	NA	0.8	T1b	5.75	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111020	NA	Normal	IBE	NA	ICR1	400004193	B X259C74	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	65	LN-	ER+	NA	NA	1	T1b	10.41666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111021	NA	ClaudinLow	IBD	WID	ICR4	400004194	B X260C91	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	58	LN-	ER+	NA	NA	2.1	T2	10.41666667	NA	NA	G2	2b	1	0.088791513	0.911208487	p53+
GSM111022	NA	LumA	IBD	PID	ICR2	400004195	B X261C94	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	76	LN-	ER+	NA	NA	1.4	T1c	10.41666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111023	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004196	B X262C85	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	71	LN-	ER+	NA	NA	2	T1c	10.41666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111024	NA	LumA	IBD	PID	ICR2	400004197	B X263C82	DistantMetastasis	8.08	Recurred/Progressed	NA	NA	71	LN-	ER+	NA	NA	2	T1c	8.08333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111025	NA	LumB	IBD	PID	ICR1	400004198	B X265C40	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	76	LN-	ER+	NA	NA	1.8	T1c	10.41666667	NA	NA	G2	2a	1	0.776189238	0.223810762	p53-
GSM111026	NA	NA	NA	NA	NA	400004199	B X266C51	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	58	LN-	ER+	NA	NA	2.2	T2	10.41666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111027	NA	LumB	IBD	PID	ICR1	400004200	B X267C04	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	84	LN-	ER+	NA	NA	2.8	T2	10.33333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111028	NA	NA	NA	NA	NA	400004201	B X268C87	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	32	LN-	ER+	NA	NA	1.5	T1c	10.33333333	NA	NA	G2	2b	1	0.000680426	0.999319574	p53+
GSM111029	NA	Basal	IBE	PID	ICR1	400004202	B X269C68	DistantMetastasisFree	0.001	DiseaseFree	NA	NA	46	LN+	ER-	NA	NA	2.5	T2	0	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM111030	NA	Basal	IBE	FID	ICR4	400004203	B X26C23	DistantMetastasis	1.17	Recurred/Progressed	NA	NA	39	LN+	ER+	NA	NA	1.9	T1c	1.16666667	NA	NA	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53-
GSM111031	NA	Her2	IBE	WID	ICR3	400004204	B X270C93	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	40	LN+	ER-	NA	NA	3.3	T2	10.33333333	NA	NA	G3	3-like	NA	0.002690583	0.997309417	p53-
GSM111032	NA	Her2	IBE	PID	ICR3	400004205	B X271C71	DistantMetastasis	1.17	Recurred/Progressed	NA	NA	66	LN+	ER-	NA	NA	2.9	T2	1.16666667	NA	NA	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53-
GSM111033	NA	Normal	IBE	NA	ICR3	400004206	B X272C88	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	45	LN-	ER+	NA	NA	1.7	T1c	10.33333333	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111034	NA	LumA	IBD	PID	ICR2	400004207	B X274C81	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	66	LN-	ER+	NA	NA	1.6	T1c	10.33333333	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111035	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004208	B X275C70	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	69	LN-	ER+	NA	NA	1.7	T1c	10.25	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111036	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004209	B X277C64	DistantMetastasisFree	8.58	DiseaseFree	NA	NA	79	LN-	ER+	NA	NA	2	T1c	8.58333333	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111037	NA	Her2	IBD	FID	ICR4	400004210	B X278C80	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	56	LN-	ER+	NA	NA	1.1	T1c	10.25	NA	NA	G2	2b	1	0.349371373	0.650628627	p53-
GSM111038	NA	NA	NA	NA	NA	400004211	B X279C61	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	50	LN-	ER+	NA	NA	1.9	T1c	10.16666667	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM111039	NA	Normal	IBE	NA	ICR3	400004212	B X27C82	DistantMetastasisFree	6.83	DiseaseFree	NA	NA	67	LN+	ER+	NA	NA	1.3	T1c	6.83333333	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111040	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004213	B X280C43	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	45	LN-	ER+	NA	NA	1.1	T1c	1	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111041	NA	NA	NA	NA	NA	400004214	B X282C51	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	55	LN-	ER+	NA	NA	1	T1b	9.91666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.733007209	0.266992791	p53-
GSM111042	NA	NA	NA	NA	NA	400004215	B X284C63	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	48	LN-	ER+	NA	NA	1.8	T1c	10.08333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53+
GSM111043	NA	LumA	IBD	PID	ICR2	400004216	B X286C91	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	62	LN-	ER+	NA	NA	2	T1c	10	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111044	NA	Basal	IBE	PID	ICR3	400004217	B X287C67	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	37	LN+	ER+	NA	NA	2	T1c	10	NA	NA	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM111045	NA	LumA	IBD	PID	ICR3	400004218	B X288C57	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	88	LN+	ER+	NA	NA	3.8	T2	10	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111046	NA	LumA	IBD	PID	ICR2	400004219	B X289C75	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	52	LN+	ER+	NA	NA	2	T1c	10	NA	1	G1	1-like	NA	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111047	NA	NA	NA	NA	NA	400004220	B X28C76	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	56	LN-	ER+	NA	NA	0.9	T1b	10.5	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111048	NA	LumA	IBD	WID	ICR2	400004221	B X290C91	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	75	LN-	ER-	NA	NA	1.8	T1c	10	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111049	NA	Basal	IBE	FID	ICR4	400004222	B X291C17	DistantMetastasisFree	0.92	DiseaseFree	NA	NA	84	LN-	ER-	NA	NA	4.2	T2	0.91666667	NA	NA	G3	3-like	NA	0.161365219	0.838634781	p53+
GSM111050	NA	NA	NA	NA	NA	400004223	B X292C66	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	51	LN-	ER+	NA	NA	2	T1c	10	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111051	NA	Her2	IBD	PID	ICR2	400004224	B X294C04	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	43	LN-	ER+	NA	NA	2.5	T2	10	NA	NA	G1	1-like	NA	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111052	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004225	B X296C95	DistantMetastasisFree	9.92	DiseaseFree	NA	NA	73	LN-	ER+	NA	NA	1.3	T1c	9.91666667	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111053	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004226	B X297C26	DistantMetastasisFree	9.92	DiseaseFree	NA	NA	51	LN+	ER+	NA	NA	3	T2	9.91666667	NA	NA	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111054	NA	Her2	IBD	PID	ICR2	400004227	B X298C47	DistantMetastasis	6.5	Recurred/Progressed	NA	NA	62	LN-	ER+	NA	NA	2.4	T2	6.5	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111055	NA	Basal	IBE	WID	ICR2	400004228	B X301C66	DistantMetastasisFree	9.92	DiseaseFree	NA	NA	74	LN-	ER+	NA	NA	3.2	T2	9.91666667	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53+
GSM111056	NA	Basal	IBE	WID	ICR4	400004229	B X303C36	DistantMetastasisFree	9.92	DiseaseFree	NA	NA	37	LN-	ER-	NA	NA	2.3	T2	9.91666667	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM111057	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004230	B X304C89	DistantMetastasis	2.58	Recurred/Progressed	NA	NA	54	LN-	ER+	NA	NA	1.5	T1c	2.58333333	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53-
GSM111058	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004231	B X307C50	DistantMetastasisFree	9.83	DiseaseFree	NA	NA	66	LN-	ER+	NA	NA	2.4	T2	9.83333333	NA	1	G2	2a	NA	0.776189238	0.223810762	p53-
GSM111059	NA	Basal	IBE	PID	ICR3	400004232	B X308C93	DistantMetastasis	2.25	Recurred/Progressed	NA	NA	38	LN-	ER-	NA	NA	2.1	T2	2.25	NA	NA	G2	2b	1	0.004539265	0.995460735	p53+
GSM111060	NA	NA	NA	NA	NA	400004233	B X309C49	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	44	LN-	ER+	NA	NA	1.2	T1c	9.83333333	NA	NA	G1	3-like	1	0.285474593	0.714525407	p53-
GSM111061	NA	Her2	IBE	PID	ICR1	400004234	B X311A27	DistantMetastasis	1.75	Recurred/Progressed	NA	NA	70	LN+	ER+	NA	NA	3.2	T2	0.58333333	NA	1	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM111062	NA	Basal	IBE	FID	ICR4	400004235	B X313A87	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	65	LN+	ER+	NA	NA	2.8	T2	10.16666667	NA	1	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM111063	NA	Basal	IBE	WID	ICR4	400004236	B X314B55	DistantMetastasis	9.58	Recurred/Progressed	NA	NA	38	LN-	ER-	NA	NA	3	T2	0.16666667	NA	NA	G3	3-like	1	0.002244165	0.997755835	p53+
GSM111064	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004237	B X316C65	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	51	LN-	ER+	NA	NA	1.3	T1c	10.75	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111065	NA	Normal	IBE	NA	ICR4	400004238	B X33C30	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	49	LN+	ER+	NA	NA	1.8	T1c	10.16666667	NA	NA	G1	1-like	NA	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111066	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004239	B X34C80	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	67	LN-	ER+	NA	NA	2	T1c	10.16666667	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111067	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004240	B X35C29	DistantMetastasisFree	6.08	Recurred/Progressed	NA	NA	45	LN-	ER+	NA	NA	2.3	T2	2.41666667	NA	1	G2	2b	NA	0.201789498	0.798210502	p53-
GSM111068	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004241	B X36C17	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	46	LN-	ER+	NA	NA	2.2	T2	10.08333333	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111069	NA	Basal	IBE	FID	ICR4	400004242	B X37C06	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	73	LN-	ER+	NA	NA	1.5	T1c	10	NA	NA	G3	3-like	1	0.015291208	0.984708792	p53+
GSM111070	NA	LumA	IBD	PID	ICR2	400004243	B X39C24	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	52	LN+	ER+	NA	NA	1.7	T1c	10	NA	1	G1	1-like	NA	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111071	NA	LumA	IBD	WID	ICR3	400004244	B X40C57	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	56	LN+	ER+	NA	NA	2.2	T2	10	NA	1	G2	2a	NA	0.876553	0.123447	p53-
GSM111072	NA	Her2	IBD	WID	ICR1	400004245	B X41C65	DistantMetastasisFree	9.92	DiseaseFree	NA	NA	61	LN+	ER+	NA	NA	2.2	T2	9.91666667	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111073	NA	LumB	IBD	PID	ICR2	400004246	B X42C57	DistantMetastasisFree	9.92	DiseaseFree	NA	NA	59	LN-	Unknown	NA	NA	2.6	T2	9.91666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.886663152	0.113336848	p53-
GSM111074	NA	NA	NA	NA	NA	400004247	B X43C47	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	46	LN-	ER+	NA	NA	1.2	T1c	9.91666667	NA	NA	G2	2a	1	0.876553	0.123447	p53-
GSM111075	NA	Normal	IBE	NA	ICR1	400004248	B X44A53	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	41	LN+	ER+	NA	NA	1.9	T1c	12.75	NA	NA	G2	2b	NA	0.121809745	0.878190255	p53-
GSM111076	NA	LumB	IBD	PID	ICR1	400004249	B X45A96	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	75	LN-	ER+	NA	NA	1.8	T1c	7.58333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.780253952	0.219746048	p53-
GSM111077	NA	LumB	IBE	PID	ICR1	400004250	B X46A25	DistantMetastasis	0.001	Recurred/Progressed	NA	NA	74	LN+	ER+	NA	NA	2.2	T2	0	NA	1	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM111078	NA	Her2	IBE	FID	ICR4	400004251	B X47A87	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	61	LN+	ER-	NA	NA	5.3	T3/T4	9.58333333	NA	NA	G2	2b	1	0.000680426	0.999319574	p53-
GSM111079	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004252	B X48A46	DistantMetastasisFree	1.83	DiseaseFree	NA	NA	78	NA	ER+	NA	NA	3.8	T2	1.83333333	NA	1	G1	1-like	NA	0.676974189	0.323025811	p53-
GSM111080	NA	LumA	IBD	FID	ICR4	400004253	B X49A07	DistantMetastasis	6.67	Recurred/Progressed	NA	NA	80	LN-	ER+	NA	NA	1.4	T1c	4.91666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111081	NA	Normal	IBE	NA	ICR4	400004254	B X50A91	DistantMetastasis	9.08	Recurred/Progressed	NA	NA	47	LN+	ER+	NA	NA	2.2	T2	9.08333333	NA	NA	G2	2a	NA	0.776189238	0.223810762	p53+
GSM111082	NA	LumB	IBE	FID	ICR4	400004255	B X51A98	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	59	LN+	ER+	NA	NA	3.2	T2	12.66666667	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111083	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004256	B X52A90	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	53	LN-	ER+	NA	NA	2.4	T2	12.66666667	NA	NA	G1	3-like	1	0.010018639	0.989981361	p53-
GSM111084	NA	LumB	IBD	WID	ICR2	400004257	B X53A06	DistantMetastasis	3.17	Recurred/Progressed	NA	NA	82	LN+	ER+	NA	NA	2.1	T2	2.58333333	NA	1	G2	2b	NA	0.201789498	0.798210502	p53-
GSM111085	NA	Basal	IBE	PID	ICR3	400004258	B X54A09	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	68	LN-	ER-	NA	NA	1.4	T1c	0.58333333	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM111086	NA	Her2	IBE	PID	ICR1	400004259	B X55A79	DistantMetastasisFree	3.25	DiseaseFree	NA	NA	62	LN+	ER+	NA	NA	4.1	T2	3.25	NA	1	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53-
GSM111087	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004260	B X56A94	DistantMetastasis	1.08	Recurred/Progressed	NA	NA	52	LN+	ER+	NA	NA	4.5	T2	1.08333333	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111088	NA	Her2	IBE	PID	ICR3	400004261	B X58A50	DistantMetastasis	1.33	Recurred/Progressed	NA	NA	47	LN+	ER+	NA	NA	0.8	T1b	0.41666667	NA	NA	G2	2b	NA	0.000680426	0.999319574	p53-
GSM111089	NA	Her2	IBE	FID	ICR4	400004262	B X5B97	DistantMetastasis	5.5	Recurred/Progressed	NA	NA	37	LN-	ER+	NA	NA	2.6	T2	0.75	NA	NA	G2	2b	1	0.000680426	0.999319574	p53+
GSM111090	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004263	B X60A05	DistantMetastasis	0.67	Recurred/Progressed	NA	NA	77	LN-	ER+	NA	NA	3.6	T2	0.66666667	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111091	NA	LumB	IBD	WID	ICR2	400004264	B X61A53	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	68	LN-	ER+	NA	NA	1.4	T1c	6.08333333	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111092	NA	Basal	IBE	PID	ICR3	400004265	B X62A02	DistantMetastasis	0.25	Recurred/Progressed	NA	NA	77	LN-	ER-	NA	NA	2.4	T2	0.25	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM111093	NA	Basal	IBE	WID	ICR3	400004266	B X63A62	DistantMetastasis	0.17	Recurred/Progressed	NA	NA	55	LN+	ER+	NA	NA	2.4	T2	0.16666667	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111094	NA	Basal	IBE	FID	ICR4	400004267	B X64A59	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	61	LN-	ER+	NA	NA	2.8	T2	12.41666667	NA	1	G2	2b	NA	0.045745654	0.954254346	p53+
GSM111095	NA	Normal	IBE	NA	ICR1	400004268	B X65A68	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	49	LN-	ER+	NA	NA	1.8	T1c	12.41666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111096	NA	Her2	IBE	PID	ICR3	400004269	B X66A84	DistantMetastasis	1.25	Recurred/Progressed	NA	NA	48	LN+	ER+	NA	NA	3.5	T2	1.25	NA	NA	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM111097	NA	Her2	IBE	PID	ICR2	400004270	B X67A43	DistantMetastasis	0.92	Recurred/Progressed	NA	NA	79	LN+	ER-	NA	NA	2.8	T2	0.91666667	NA	NA	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53-
GSM111098	NA	Basal	IBE	PID	ICR2	400004271	B X69A93	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	62	LN+	ER+	NA	NA	5	T2	12.41666667	NA	1	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM111099	NA	LumB	IBE	PID	ICR1	400004272	B X6B85	DistantMetastasis	0.58	Recurred/Progressed	NA	NA	71	LN+	ER+	NA	NA	2.6	T2	0.58333333	NA	1	G1	1-like	NA	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111100	NA	Basal	IBE	FID	ICR4	400004273	B X70A79	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	87	NA	ER+	NA	NA	1.5	T1c	12	NA	NA	G3	3-like	1	0.033528353	0.966471647	p53-
GSM111101	NA	LumA	IBD	FID	ICR3	400004274	B X72A92	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	55	LN-	ER+	NA	NA	1.6	T1c	12.33333333	NA	1	G1	1-like	NA	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111102	NA	Her2	IBD	FID	ICR3	400004275	B X73A01	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	44	LN+	ER+	NA	NA	13	T3/T4	12.33333333	NA	NA	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM111103	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004276	B X74A63	DistantMetastasis	5.92	Recurred/Progressed	NA	NA	56	LN-	ER+	NA	NA	2.2	T2	5.91666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111104	NA	LumB	IBD	PID	ICR1	400004277	B X75A01	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	69	LN-	ER+	NA	NA	1.9	T1c	3.58333333	NA	NA	G2	2b	1	0.201789498	0.798210502	p53-
GSM111105	NA	LumB	IBE	WID	ICR3	400004278	B X76A44	DistantMetastasis	0.001	Recurred/Progressed	NA	NA	81	LN+	ER+	NA	NA	6.5	T3/T4	0	NA	1	G3	3-like	NA	0.000672948	0.999327052	p53+
GSM111106	NA	LumA	IBD	FID	ICR3	400004279	B X77A50	DistantMetastasis	1.08	Recurred/Progressed	NA	NA	75	LN+	ER+	NA	NA	2	T1c	1.08333333	NA	1	G2	2a	NA	0.659102499	0.340897501	p53-
GSM111107	NA	Her2	IBE	WID	ICR4	400004280	B X79A35	DistantMetastasisFree	0.83	DiseaseFree	NA	NA	65	LN+	ER-	NA	NA	2.5	T2	0.83333333	NA	NA	G3	1-like	NA	0.996624473	0.003375527	p53+
GSM111108	NA	Her2	IBD	PID	ICR2	400004281	B X7B96	DistantMetastasis	2.42	Recurred/Progressed	NA	NA	52	LN+	ER+	NA	NA	1.9	T1c	2.41666667	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53+
GSM111109	NA	LumB	IBD	PID	ICR1	400004282	B X82A83	DistantMetastasisFree	2.58	DiseaseFree	NA	NA	72	LN+	ER+	NA	NA	2.7	T2	2.58333333	NA	1	G3	3-like	NA	0.004712747	0.995287253	p53+
GSM111110	NA	Normal	IBE	NA	ICR1	400004283	B X83A37	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	69	LN-	ER+	NA	NA	2.2	T2	12.16666667	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53?
GSM111111	NA	LumB	IBE	PID	ICR1	400004284	B X84A44	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	84	LN-	ER+	NA	NA	2.8	T2	12.16666667	NA	1	G2	2b	NA	0.017064846	0.982935154	p53-
GSM111112	NA	Her2	IBD	PID	ICR1	400004285	B X85A03	DistantMetastasisFree	2.08	DiseaseFree	NA	NA	86	LN+	ER+	NA	NA	1.5	T1c	2.08333333	NA	1	G2	2a	NA	0.776189238	0.223810762	p53-
GSM111113	NA	Basal	IBE	PID	ICR1	400004286	B X86A40	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	61	LN-	ER-	NA	NA	2.4	T2	12.16666667	NA	NA	G2	2b	1	0.000680426	0.999319574	p53+
GSM111114	NA	NA	NA	NA	NA	400004287	B X87A79	NA	NA	DiseaseFree	NA	NA	36	LN-	ER+	NA	NA	1.2	T1c	12.08333333	NA	NA	G2	2a	1	0.659102499	0.340897501	p53-
GSM111115	NA	LumB	IBD	PID	ICR3	400004288	B X88A67	DistantMetastasisFree	10	Recurred/Progressed	NA	NA	63	LN-	ER+	NA	NA	2.4	T2	4.25	NA	NA	G2	2b	1	0.02872777	0.97127223	p53-
GSM111116	NA	Her2	IBE	FID	ICR4	400004289	B X89A64	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	60	LN-	ER+	NA	NA	2.3	T2	12.08333333	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53?
GSM111117	NA	LumA	IBD	WID	ICR2	400004290	B X8B87	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	58	LN-	ER+	NA	NA	1.7	T1c	11.33333333	NA	1	G1	1-like	NA	0.959265176	0.040734824	p53-
GSM111118	NA	Her2	IBE	FID	ICR4	400004291	B X90A63	DistantMetastasisFree	2.67	DiseaseFree	NA	NA	76	LN-	ER+	NA	NA	2.6	T2	2.66666667	NA	NA	G3	3-like	1	0.000672948	0.999327052	p53-
GSM111119	NA	Normal	IBE	NA	ICR3	400004292	B X94A16	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	73	LN-	ER+	NA	NA	0.6	T1b	11.08333333	NA	NA	G2	2a	1	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111120	NA	LumA	IBD	PID	ICR2	400004293	B X96A21	DistantMetastasis	0.08	Recurred/Progressed	NA	NA	63	LN+	ER+	NA	NA	3.8	T2	0.08333333	NA	1	G2	2a	NA	0.959292983	0.040707017	p53-
GSM111121	NA	Basal	IBE	WID	ICR2	400004294	B X99A50	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	82	LN-	ER+	NA	NA	1.9	T1c	10.5	NA	NA	G1	1-like	1	0.959265176	0.040734824	p53+
GSM111122	NA	LumB	IBD	WID	ICR4	400004295	B X9B52	DistantMetastasisFree	10	DiseaseFree	NA	NA	71	LN-	ER+	NA	NA	1.2	T1c	11.33333333	NA	NA	G2	2a	1	0.876553	0.123447	p53-
GSM119978	NA	LumA	IBD	WID	ICR4	400004296	B NUH.BT009	DistantMetastasisFree	6.17	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-71	NA	G2	2b	NA	0.122	0.878	NA
GSM119979	NA	LumB	IBE	WID	ICR3	400004297	B NUH.BT014	DistantMetastasis	1.13	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-2	NA	G2	2b	NA	0.001	0.999	NA
GSM119980	NA	Normal	IBE	NA	ICR1	400004298	B NUH.BT018	DistantMetastasisFree	4.29	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-22	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM119981	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004299	B NUH.BT019	DistantMetastasisFree	5.88	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-99	NA	G2	2a	NA	0.924	0.076	NA
GSM119982	NA	LumA	IBD	PID	ICR2	400004300	B NUH.BT022	DistantMetastasisFree	2.63	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-62	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM119983	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004301	B NUH.BT023	DistantMetastasisFree	6.25	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-64	NA	G2	2a	NA	0.776	0.224	NA
GSM119984	NA	LumB	IBD	WID	ICR3	400004302	B NUH.BT029	DistantMetastasis	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-178	NA	G2	2b	NA	0.006	0.994	NA
GSM119985	NA	Normal	IBE	NA	ICR2	400004303	B NUH.BT031	DistantMetastasisFree	5.63	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-221	NA	G2	2b	NA	0.442	0.558	NA
GSM119986	NA	Normal	IBE	NA	ICR3	400004304	B NUH.BT035	DistantMetastasisFree	4.04	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT01-41	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM119987	NA	NA	IBE	NA	ICR2	400004305	B NUH.BT042	DistantMetastasisFree	6	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-75	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM119988	NA	ClaudinLow	IBD	WID	ICR2	400004306	B NUH.BT046	DistantMetastasisFree	5.79	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-91	NA	G2	2a	NA	0.894	0.106	NA
GSM119989	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004307	B NUH.BT047	DistantMetastasisFree	5.83	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-113	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM119990	NA	LumB	IBD	WID	ICR2	400004308	B NUH.BT049	DistantMetastasisFree	5.75	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-121	NA	G2	2a	NA	0.703	0.297	NA
GSM119991	NA	Normal	IBE	NA	ICR3	400004309	B NUH.BT054	DistantMetastasisFree	5.58	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-1	NA	G2	2b	NA	0.004	0.996	NA
GSM119992	NA	Her2	IBD	PID	ICR2	400004310	B NUH.BT055	DistantMetastasisFree	6.33	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-21	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM119993	NA	NA	NA	NA	NA	400004311	B NUH.BT058	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-167	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM119994	NA	NA	NA	NA	NA	400004312	B NUH.BT061	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-128	NA	G2	2b	NA	0.003	0.997	NA
GSM119995	NA	Basal	IBD	WID	ICR2	400004313	B NUH.BT067	DistantMetastasisFree	5	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-222	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM119996	NA	Her2	IBD	WID	ICR2	400004314	B NUH.BT068	DistantMetastasisFree	5.25	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-219	NA	G2	2a	NA	0.894	0.106	NA
GSM119997	NA	Her2	IBD	PID	ICR1	400004315	B NUH.BT070	DistantMetastasis	0.04	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-226	NA	G2	2a	NA	0.894	0.106	NA
GSM119998	NA	LumB	IBD	FID	ICR4	400004316	B NUH.BT074	DistantMetastasisFree	0.67	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-200	NA	G2	2b	NA	0.008	0.992	NA
GSM119999	NA	Her2	IBD	FID	ICR2	400004317	B NUH.BT078	DistantMetastasis	2.83	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-210	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM120000	NA	Her2	IBE	FID	ICR4	400004318	B NUH.BT083	DistantMetastasisFree	0.67	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT01-92	NA	G2	2b	NA	0.141	0.859	NA
GSM120001	NA	NA	NA	NA	NA	400004319	B NUH.BT085	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT01-91	NA	G2	2b	NA	0.122	0.878	NA
GSM120002	NA	Basal	IBE	PID	ICR4	400004320	B NUH.BT086	DistantMetastasisFree	4.67	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT01-76	NA	G2	2b	NA	0.001	0.999	NA
GSM120003	NA	Basal	IBE	FID	ICR4	400004321	B NUH.BT087	DistantMetastasisFree	5.67	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT01-69	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM120004	NA	Basal	IBE	FID	ICR4	400004322	B NUH.BT088	DistantMetastasisFree	4.67	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT01-68	NA	G2	2a	NA	0.584	0.416	NA
GSM120005	NA	ClaudinLow	IBD	PID	ICR1	400004323	B NUH.BT090	DistantMetastasisFree	5.17	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT01-45	NA	G2	2b	NA	0.056	0.944	NA
GSM120006	NA	LumB	IBD	PID	ICR1	400004324	B NUH.BT093	DistantMetastasisFree	4.75	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT01-65	NA	G2	2a	NA	0.876	0.124	NA
GSM120007	NA	LumB	IBD	PID	ICR1	400004325	B NUH.BT094	DistantMetastasisFree	4.92	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT01-27	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM120008	NA	LumB	IBD	PID	ICR2	400004326	B NUH.BT095	DistantMetastasisFree	0.42	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT01-53	NA	G2	2a	NA	0.924	0.076	NA
GSM120009	NA	LumB	IBD	WID	ICR3	400004327	B NUH.BT096	DistantMetastasis	1.67	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT01-31	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM120010	NA	LumB	IBD	WID	ICR3	400004328	B NUH.BT097	DistantMetastasisFree	4.5	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT02-11	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM120011	NA	LumA	IBD	PID	ICR1	400004329	B NUH.BT103	DistantMetastasisFree	4.88	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT01-10	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM120012	NA	Her2	IBD	PID	ICR1	400004330	B NUH.BT104	DistantMetastasisFree	4.83	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT01-03	NA	G2	2b	NA	0.479	0.521	NA
GSM120013	NA	LumB	IBD	PID	ICR1	400004331	B NUH.BT108	DistantMetastasisFree	4	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT02-23	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM120014	NA	NA	NA	NA	NA	400004332	B NUH.BT111	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT02-22	NA	G2	2b	NA	0.085	0.915	NA
GSM120015	NA	LumB	IBD	WID	ICR1	400004333	B NUH.BT113	DistantMetastasisFree	5.58	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT00-165	NA	G2	2a	NA	0.876	0.124	NA
GSM120016	NA	LumA	IBD	WID	ICR3	400004334	B NUH.BT114	DistantMetastasisFree	5.33	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT01-16	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA
GSM120017	NA	ClaudinLow	IBD	PID	ICR1	400004335	B NUH.BT119	DistantMetastasisFree	5	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT01-08	NA	G2	2a	NA	0.959	0.041	NA

Group Sets View in Gene Expression Browser

Name
All Samples	Default	View
ER Status		View
Histology Differentiation Grade		View
Immune Benefit Status		View
Immunological Constant of Rejection		View
Lymph Node Status		View
Molecular Subtype		View
P53 Mutation Status		View
Pathology T Stage		View
In order to make new Group Sets or change settings, please log in.

Module Analysis

Group Set
All Samples
ER Status
Histology Differentiation Grade
Immune Benefit Status
Immunological Constant of Rejection
Lymph Node Status
Molecular Subtype
P53 Mutation Status
Pathology T Stage

SIDRA