You are not logged in. | Log in
In Progress
Clinical

Node Negative

Purpose

Genome-wide measures of gene expression can identify patterns of gene activity that subclassify tumours and might provide a better means than is currently available for individual risk assessment in patients with lymph-node-negative breast cancer. This study aimed to develop a gene-expression-based algorithm and to use it to provide quantitative predictions on disease outcome for patients with lymph-node-negative breast cancer.

Hypothesis

The hypothesis of this study was that a gene expression profile could accurately predict distant tumour recurrence in patients with lymph-node-negative breast cancer.

Experimental Design

The study cohort consists of patients with lymph-node-negative breast cancer who were treated during 1980–95, but who did not receive systemic neoadjuvant or adjuvant therapy. Frozen tumour samples from were selected from the tumour bank at the Erasmus Medical Center (Rotterdam, Netherlands).

Tumour samples were submitted to the reference laboratory from 25 regional hospitals for measurements of steroid-hormone receptors. Guidelines for primary treatment were similar for all hospitals. Selection of tumours aimed to avoid bias. On the assumption of a relapse rate of 25–30% in 5 years, and a substantial loss of tumours for quality-control reasons, 436 samples of invasive tumours were processed. Patients with poor, intermediate, and good clinical outcome were included. Samples were rejected on the basis of insufficient tumour content (53), poor RNA quality (77), or poor chip quality (20); thus, 286 samples were eligible for further analysis. The study was approved by institutional medical ethics committee (number 02·953).

The median age of the patients at surgery was 52 years (range 26–83). 219 had undergone breast-conserving surgery and 67 modified radical mastectomy. Radiotherapy was given to 248 patients (87%) according to our institutional protocol. The proportions of patients who underwent breast-conserving therapy and radiotherapy are normal for lymph-node-negative disease. Patients were included irrespective of radiotherapy status.

Lymph-node negativity was based on pathological examination by regional pathologists as described by Foekens et al. All 286 tumour samples were confirmed to have sufficient (>70%) tumour and uniform involvement of tumour in 5 µm frozen sections stained with haematoxylin and eosin.

Postoperative follow-up involved examinations every 3 months for 2 years, every 6 months for years 3–5, and every 12 months from year 5. The date of diagnosis of metastasis was defined as that at confirmation of metastasis after symptoms reported by the patient, detection of clinical signs, or at regular follow-up.

Experimental Variables

--

Controls

--

Methods

Total RNA was isolated from 20–40 cryostat sections of 30 µm thickness (50–100 mg) with RNAzol B (Campro Scientific, Veenendaal, Netherlands). Biotinylated targets were prepared by published methods (Affymetrix, Santa Clara, CA, USA, Lipshutz et al) and hybridised to the Affymetrix oligonucleotide microarray U133a GeneChip. Arrays were scanned by standard Affymetrix protocols. Each probe set was treated as a separate gene. Expression values were calculated by use of Affymetrix GeneChip analysis software MAS 5.0. Chips with average intensity of less than 40 or background signal of more than 100 were rejected. For chip normalisation, probe sets were scaled to a target intensity of 600, and scale mask files were not selected.

Additional Information

Wang, Yixin, Jan G. M. Klijn, Yi Zhang, Anieta M. Sieuwerts, Maxime P. Look, Fei Yang, Dmitri Talantov, et al. “Gene-Expression Profiles to Predict Distant Metastasis of Lymph-Node-Negative Primary Breast Cancer.” Lancet (London, England) 365, no. 9460 (February 19, 2005): 671–79. doi:10.1016/S0140-6736(05)17947-1.

Foekens, J. A., H. Portengen, W. L. van Putten, A. M. Trapman, J. C. Reubi, J. Alexieva-Figusch, and J. G. Klijn. “Prognostic Value of Receptors for Insulin-like Growth Factor 1, Somatostatin, and Epidermal Growth Factor in Human Breast Cancer.” Cancer Research 49, no. 24 Pt 1 (December 15, 1989): 7002–9.

Lipshutz, R. J., S. P. Fodor, T. R. Gingeras, and D. J. Lockhart. “High Density Synthetic Oligonucleotide Arrays.” Nature Genetics 21, no. 1 Suppl (January 1999): 20–24. doi:10.1038/4447.

Microarray
Affymetrix HG-U133A
286 Samples Loaded: 286
Human (Homo sapiens)
Nagalla 2013 , Erasmus Medical Center (EMC), the Netherlands , Breast Cancer Tissue
LN- Breast Cancer
Sample Set Spreadsheet
Please log in in order to upload files.
Samples Preview
Sample ID series IMS IBS IDS ICR
GSM36777 NA LumA IBD WID ICR1
GSM36778 NA Her2 IBE PID ICR2
GSM36779 NA LumA IBD PID ICR2
GSM36780 NA Her2 IBD FID ICR3
GSM36781 NA Her2 IBE FID ICR4
Please log in in order to upload files.
File
GSE2034_appended.meta.data_v1.csv
Sample Set Spreadsheet
Average Normalized
  •   |  View in GXB »
Clinical Datasource
Links

Samples Viewer / Editor

All fields are editable except the "Sample ID" column. To edit a cell, click within the cell. To edit a "date" cell, click on the calendar icon. To cancel an edit, press the ESC key.

Sample ID Series IMS IBS IDS ICR Array Sample ID Sample Title DMFS 10Y EVENT DMFS 10Y TIME Disease Free Survival Event Disease Free Survival Distant Met Free Survival Event Distant Met Free Survival Age At Initial Pathologic Diagnosis Lymph Node Status ER Status PR Status Histology Differentiation Grade Tumor Size Cm Pathology T Stage Bone Metastasis Event
GSM36777
NA
LumA
IBD
WID
ICR1
400002312
Wang4812_JA_277
DistantMetastasisFree
6.58
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36778
NA
Her2
IBE
PID
ICR2
400002313
Wang4813_JA_278
DistantMetastasis
4.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36779
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002314
Wang4630_JA798@C
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36780
NA
Her2
IBD
FID
ICR3
400002315
Wang4889_JA_846@2
DistantMetastasisFree
7
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36781
NA
Her2
IBE
FID
ICR4
400002316
Wang4857_JA_765@2
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36782
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002317
Wang4585_JA600
DistantMetastasisFree
5.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36783
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002318
Wang4586_JA601
DistantMetastasisFree
4.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36784
NA
LumA
IBD
WID
ICR3
400002319
Wang4587_JA602
DistantMetastasis
4.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36785
NA
LumB
IBD
PID
ICR1
400002320
Wang4820_JA_605
DistantMetastasisFree
4.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36786
NA
Normal
IBE
NA
ICR2
400002321
Wang4821_JA_606
DistantMetastasisFree
5.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36787
NA
LumB
IBD
PID
ICR2
400002322
Wang4816_JA_284
DistantMetastasisFree
6
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36788
NA
Basal
IBE
FID
ICR4
400002323
0080_2622_H133A_SMJ20
DistantMetastasisFree
6.58
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36789
NA
LumB
IBD
PID
ICR1
400002324
Wang4580_JA285
DistantMetastasis
4.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36790
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002325
Wang4817_JA_286
DistantMetastasisFree
8.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36791
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002326
Wang4581_JA287
DistantMetastasisFree
6.58
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36792
NA
LumB
IBD
PID
ICR2
400002327
Wang4582_JA288
DistantMetastasis
5.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36793
NA
Normal
IBE
NA
ICR2
400002328
Wong646subA
DistantMetastasisFree
8.42
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36794
NA
ClaudinLow
IBD
FID
ICR4
400002329
Wang4628_JA791@2
DistantMetastasisFree
7.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36795
NA
Basal
IBE
WID
ICR3
400002330
Wang4896_JA_855@2
DistantMetastasisFree
7.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36796
NA
LumA
IBD
WID
ICR3
400002331
Wong647subA
DistantMetastasisFree
9.83
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36797
NA
Basal
IBE
WID
ICR2
400002332
Wong648subA
DistantMetastasis
0.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36798
NA
Basal
IBE
FID
ICR4
400002333
Wong649subA
DistantMetastasisFree
8.83
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36799
NA
LumB
IBD
WID
ICR3
400002334
Wang4823_JA_611
DistantMetastasisFree
6.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36800
NA
LumB
IBD
PID
ICR2
400002335
Wang650_JA-8
DistantMetastasis
3.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36801
NA
LumB
IBD
FID
ICR4
400002336
Wong651subA
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36802
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002337
Wang4824_JA_612
DistantMetastasisFree
7.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36803
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002338
Wang4825_JA_613
DistantMetastasisFree
7.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36804
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002339
Wang4826_JA_614
DistantMetastasisFree
7.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36805
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002340
Wang4818_JA_290
DistantMetastasisFree
8.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36806
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002341
Wang4827_JA_615
DistantMetastasisFree
7.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36807
NA
Normal
IBE
NA
ICR1
400002342
Wang4828_JA_616
DistantMetastasisFree
7.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36808
NA
Basal
IBE
WID
ICR2
400002343
Wang4583_JA292
DistantMetastasisFree
4.83
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36809
NA
ClaudinLow
IBD
WID
ICR3
400002344
Wang4584_JA293
DistantMetastasisFree
4.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36810
NA
LumB
IBD
PID
ICR1
400002345
Wang4890_JA_847@2
DistantMetastasisFree
8.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36811
NA
Normal
IBE
NA
ICR2
400002346
Wang4829_JA_620
DistantMetastasis
5.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36812
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002347
Wang4830_JA_621
DistantMetastasisFree
6.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36813
NA
Normal
IBE
NA
ICR2
400002348
Wang4819_JA_540
DistantMetastasis
4.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36814
NA
Her2
IBD
WID
ICR2
400002349
Wang4603_JA703
DistantMetastasis
5.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36815
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002350
Wang4831_JA_625
DistantMetastasis
6
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36816
NA
ClaudinLow
IBD
FID
ICR4
400002351
Wang4604_JA707
DistantMetastasisFree
8.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36817
NA
Basal
IBE
FID
ICR4
400002352
Wang4833_JA_627
DistantMetastasisFree
9.42
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36818
NA
LumB
IBD
PID
ICR1
400002353
Wang4600_JA546
DistantMetastasis
5.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36819
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002354
Wang4588_JA629
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36820
NA
LumB
IBE
PID
ICR2
400002355
Wang4617_JA749@C
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36821
NA
LumB
IBD
FID
ICR3
400002356
Wang4897_JA_856@2
DistantMetastasisFree
7.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36822
NA
Basal
IBE
WID
ICR3
400002357
Wang4598_JA710
DistantMetastasisFree
4.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36823
NA
Basal
IBE
PID
ICR2
400002358
Wang4834_JA_630
DistantMetastasisFree
9.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36824
NA
Basal
IBE
WID
ICR3
400002359
Wang4612_JA712
DistantMetastasisFree
7.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36825
NA
LumA
IBD
FID
ICR3
400002360
Wang4589_JA631
DistantMetastasisFree
8.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36826
NA
LumB
IBD
FID
ICR3
400002361
Wang4601_JA550
DistantMetastasis
4.83
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36827
NA
ClaudinLow
IBD
FID
ICR4
400002362
Wang4613_JA713
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36828
NA
Basal
IBE
WID
ICR4
400002363
Wang4835_JA_633
DistantMetastasisFree
6.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36829
NA
LumB
IBE
PID
ICR1
400002364
Wang4614_JA714
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36830
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002365
Wang4590_JA634
DistantMetastasisFree
9.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36831
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002366
Wang4839_JA_716
DistantMetastasisFree
7.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36832
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002367
Wang4836_JA_635
DistantMetastasisFree
9.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36833
NA
Her2
IBE
WID
ICR3
400002368
Wang4591_JA637
DistantMetastasisFree
4.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36834
NA
Her2
IBE
PID
ICR3
400002369
Wang652-R_JA-11
DistantMetastasisFree
9.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36835
NA
Basal
IBE
PID
ICR2
400002370
Wang653_Ja-14
DistantMetastasis
1.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36836
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002371
Wang654_Ja-15
DistantMetastasisFree
8.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36837
NA
LumB
IBD
WID
ICR3
400002372
Wong655subA
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36838
NA
LumB
IBE
PID
ICR1
400002373
Wong656subA
DistantMetastasis
2.83
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36839
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002374
Wong657subA
DistantMetastasis
2.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36840
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002375
Wang4891_JA_848@2
DistantMetastasisFree
7.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36841
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002376
Wang4858_JA_767@2
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36842
NA
Normal
IBE
NA
ICR2
400002377
Wang4592_JA640
DistantMetastasisFree
6.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36843
NA
LumA
IBD
FID
ICR2
400002378
Wang4593_JA641
DistantMetastasisFree
6.42
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36844
NA
LumB
IBE
WID
ICR3
400002379
Wang4631_JA804
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36845
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002380
Wang4594_JA642
DistantMetastasisFree
4.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36846
NA
Basal
IBE
WID
ICR4
400002381
Wang4869_JA_805
DistantMetastasisFree
8.58
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36847
NA
Basal
IBE
WID
ICR3
400002382
Wang4632_JA806
DistantMetastasisFree
7.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36848
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002383
Wang4840_JA_726
DistantMetastasisFree
8.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36849
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002384
Wang4870_JA_808
DistantMetastasisFree
9.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36850
NA
LumA
IBD
WID
ICR3
400002385
Wang4841_JA_727
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36851
NA
Basal
IBD
FID
ICR4
400002386
Wang4595_JA646
DistantMetastasisFree
8.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36852
NA
LumA
IBD
WID
ICR3
400002387
Wang4871_JA_809
DistantMetastasisFree
8.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36853
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002388
Wang4842_JA_728
DistantMetastasisFree
8.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36854
NA
ClaudinLow
IBD
FID
ICR4
400002389
Wang4596_JA647
DistantMetastasisFree
8.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36855
NA
ClaudinLow
IBD
PID
ICR2
400002390
Wang658_JA-20
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36856
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002391
Wang4843_JA_729
DistantMetastasisFree
7.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36857
NA
LumA
IBD
FID
ICR4
400002392
Wang4597_JA648
DistantMetastasisFree
7.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36858
NA
Her2
IBE
PID
ICR1
400002393
Wang659_JA-21
DistantMetastasis
1.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36859
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002394
Wang660_JA-22
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36860
NA
Her2
IBE
PID
ICR4
400002395
Wang661_JA-27
DistantMetastasis
2.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36861
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002396
Wang662_JA-28
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36862
NA
Basal
IBE
PID
ICR3
400002397
Wang663_JA-29
DistantMetastasis
2.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36863
NA
Basal
IBE
FID
ICR4
400002398
Wang4898_JA_857@2
DistantMetastasisFree
8.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36864
NA
LumA
IBD
WID
ICR1
400002399
Wang4872_JA_810
DistantMetastasisFree
7
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36865
NA
Basal
IBE
WID
ICR3
400002400
Wang4874_JA_813
DistantMetastasisFree
8.58
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36866
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002401
Wang4875_JA_815
DistantMetastasisFree
8.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36867
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002402
Wang4877_JA_817
DistantMetastasisFree
9
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36868
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002403
Wang4847_JA_737
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36869
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002404
Wang4848_JA_738
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36870
NA
LumB
IBE
PID
ICR1
400002405
Wang664_JA-31
DistantMetastasis
2.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36871
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002406
Wang665_JA-17
DistantMetastasisFree
7
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36872
NA
LumB
IBD
PID
ICR2
400002407
Wang666-R_JA-33
DistantMetastasis
0.58
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36873
NA
LumB
IBD
WID
ICR2
400002408
Wang667-2_JA-34
DistantMetastasisFree
8.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36874
NA
LumA
IBD
WID
ICR3
400002409
Wang668_JA-35
DistantMetastasis
2.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36875
NA
ClaudinLow
IBD
PID
ICR3
400002410
Wang669-2_JA-37
DistantMetastasis
0.58
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36876
NA
Basal
IBE
PID
ICR3
400002411
Wang670_JA-38
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36877
NA
LumB
IBD
FID
ICR4
400002412
Wang671_JA-39
DistantMetastasis
3.58
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36878
NA
LumB
IBD
PID
ICR1
400002413
Wang4855_JA_760@2
DistantMetastasisFree
8.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36879
NA
Her2
IBD
WID
ICR3
400002414
Wang4014_JA-100
DistantMetastasis
3.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36880
NA
LumA
IBD
WID
ICR3
400002415
Wang4015_JA-103
DistantMetastasisFree
8.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36881
NA
LumB
IBD
PID
ICR1
400002416
Wang4016_JA-104
DistantMetastasis
0.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36882
NA
Normal
IBE
NA
ICR1
400002417
Wang4017_JA-105
DistantMetastasisFree
8.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36883
NA
Normal
IBE
NA
ICR3
400002418
Wang4892_JA_849@2
DistantMetastasisFree
7.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36884
NA
Her2
IBE
WID
ICR4
400002419
Wang4859_JA_768@2
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36885
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002420
Wang4018_JA-106
DistantMetastasis
3.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36886
NA
ClaudinLow
IBD
PID
ICR2
400002421
Wang4019_JA-107
DistantMetastasisFree
7.83
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36887
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002422
Wang4914_JA_900
DistantMetastasisFree
9
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36888
NA
LumB
IBD
WID
ICR3
400002423
Wang4020_JA-108
DistantMetastasis
2.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36889
NA
ClaudinLow
IBD
FID
ICR3
400002424
Wang4915_JA_901
DistantMetastasisFree
9
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36890
NA
Basal
IBE
FID
ICR3
400002425
Wang4878_JA_820
DistantMetastasisFree
9.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36891
NA
Basal
IBE
WID
ICR3
400002426
Wang4021_JA-109
DistantMetastasisFree
7.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36892
NA
Her2
IBD
WID
ICR3
400002427
Wang4916_JA_903
DistantMetastasisFree
9.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36893
NA
LumB
IBD
PID
ICR1
400002428
Wang4849_JA_741
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36894
NA
Normal
IBE
NA
ICR4
400002429
Wang4917_JA_909
DistantMetastasisFree
9.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36895
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002430
Wang4616_JA747
DistantMetastasisFree
8
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36896
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002431
Wang672_JA-40
DistantMetastasisFree
8.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36897
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002432
Wang673_JA-41
DistantMetastasis
2.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36898
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002433
Wang4543_JA212@2
DistantMetastasis
0.58
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36899
NA
LumB
IBE
PID
ICR1
400002434
Wang674_JA-44
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36900
NA
Basal
IBE
PID
ICR2
400002435
Wang675_JA-46
DistantMetastasisFree
9.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36901
NA
Basal
IBE
PID
ICR1
400002436
Wang676_JA-48
DistantMetastasisFree
8.42
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36902
NA
ClaudinLow
IBD
FID
ICR3
400002437
Wang677_JA-49
DistantMetastasis
2.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36903
NA
LumB
IBD
PID
ICR3
400002438
Wang4022_JA-110
DistantMetastasis
0.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36904
NA
Her2
IBD
PID
ICR2
400002439
Wang4023_JA-111
DistantMetastasisFree
8.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36905
NA
ClaudinLow
IBD
FID
ICR3
400002440
Wang4024_JA-112
DistantMetastasis
1.42
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36906
NA
Her2
IBE
FID
ICR4
400002441
Wang4025_JA-113
DistantMetastasisFree
8.42
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36907
NA
LumA
IBD
FID
ICR3
400002442
Wang4026_JA-114
DistantMetastasisFree
7.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36908
NA
LumB
IBE
PID
ICR1
400002443
Wang4027_JA-115
DistantMetastasis
1.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36909
NA
ClaudinLow
IBD
WID
ICR2
400002444
Wang4028_JA-118
DistantMetastasisFree
7.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36910
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002445
Wang4851_JA_751
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36911
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002446
Wang4918_JA_913
DistantMetastasis
6.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36912
NA
ClaudinLow
IBD
WID
ICR3
400002447
Wang4879_JA_833
DistantMetastasisFree
8.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36913
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002448
Wang4852_JA_754
DistantMetastasisFree
9.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36914
NA
LumA
IBD
WID
ICR1
400002449
Wang4881_JA_836
DistantMetastasisFree
7
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36915
NA
Normal
IBE
NA
ICR3
400002450
Wang4883_JA_839
DistantMetastasisFree
8.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36916
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002451
Wang678_JA-50
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36917
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002452
Wang679_JA-54
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36918
NA
Basal
IBE
PID
ICR3
400002453
Wang680_JA-55
DistantMetastasis
0.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36919
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002454
Wang681_JA-56
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36920
NA
Her2
IBD
WID
ICR3
400002455
Wang682-C_JA-57
DistantMetastasis
1.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36921
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002456
Wang4044_JA-200
DistantMetastasisFree
9
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36922
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002457
Wang4045_JA-201
DistantMetastasisFree
9.42
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36923
NA
Basal
IBE
PID
ICR1
400002458
Wang4029_JA-121
DistantMetastasis
1.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36924
NA
LumB
IBD
PID
ICR1
400002459
Wang4046_JA-203
DistantMetastasis
2.42
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36925
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002460
Wang4030_JA-122
DistantMetastasisFree
8.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36926
NA
Her2
IBD
PID
ICR1
400002461
Wang4047_JA-204
DistantMetastasis
2
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36927
NA
Basal
IBE
PID
ICR3
400002462
Wang4031_JA-124
DistantMetastasis
0.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36928
NA
LumA
IBD
PID
ICR3
400002463
Wang4048_JA-205
DistantMetastasis
1.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36929
NA
Her2
IBD
WID
ICR4
400002464
Wang4032_JA-125
DistantMetastasisFree
7.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36930
NA
LumA
IBD
PID
ICR3
400002465
Wang4860_JA_769@2
DistantMetastasisFree
7
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36931
NA
Basal
IBE
PID
ICR3
400002466
Wang4033_JA-126
DistantMetastasis
3.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36932
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002467
Wang4885_JA_841
DistantMetastasisFree
8
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36933
NA
Her2
IBD
FID
ICR4
400002468
Wang4886_JA_843
DistantMetastasisFree
9.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36934
NA
Her2
IBE
WID
ICR3
400002469
Wang4618_JA763
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36935
NA
Basal
IBE
FID
ICR4
400002470
Wang4887_JA_844
DistantMetastasisFree
9.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36936
NA
ClaudinLow
IBD
WID
ICR3
400002471
Wang4888_JA_845
DistantMetastasisFree
9.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36937
NA
Basal
IBE
PID
ICR2
400002472
Wang683_JA-61
DistantMetastasis
0.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36938
NA
LumB
IBD
WID
ICR3
400002473
Wang684_JA-62
DistantMetastasisFree
9
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36939
NA
LumB
IBE
PID
ICR2
400002474
Wang685_JA-63
DistantMetastasis
1.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36940
NA
Basal
IBE
WID
ICR3
400002475
Wang686_JA-64
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36941
NA
Basal
IBE
WID
ICR3
400002476
Wang687_JA-65
DistantMetastasis
0.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36942
NA
LumA
IBD
PID
ICR4
400002477
Wang688_JA-66
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36943
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002478
Wang689_JA-67
DistantMetastasis
1.58
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36944
NA
Normal
IBE
NA
ICR2
400002479
Wang690_JA-68
DistantMetastasisFree
9.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36945
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002480
Wang4893_JA_851@2
DistantMetastasisFree
7.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36946
NA
LumB
IBD
PID
ICR2
400002481
Wang4034_JA-130
DistantMetastasis
2.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36947
NA
LumB
IBE
PID
ICR1
400002482
Wang4544_JA213
DistantMetastasis
1.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36948
NA
LumB
IBD
PID
ICR1
400002483
Wang4035_JA-133
DistantMetastasisFree
7.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36949
NA
Basal
IBE
FID
ICR3
400002484
Wang4545_JA215
DistantMetastasis
0.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36950
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002485
Wang4036_JA-134
DistantMetastasis
2.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36951
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002486
Wang4861_JA_778@2
DistantMetastasisFree
8.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36952
NA
Basal
IBE
PID
ICR2
400002487
Wang4567_JA216
DistantMetastasis
1.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36953
NA
Basal
IBE
WID
ICR3
400002488
Wang4037_JA-135
DistantMetastasisFree
7
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36954
NA
LumB
IBE
PID
ICR2
400002489
Wang4546_JA217
DistantMetastasis
1.58
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36955
NA
Her2
IBD
WID
ICR4
400002490
Wang4038_JA-136
DistantMetastasis
2.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36956
NA
LumB
IBD
PID
ICR1
400002491
Wang4039_JA-137
DistantMetastasis
2.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36957
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002492
Wang4040_JA-138
DistantMetastasis
3.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36958
NA
Normal
IBE
NA
ICR3
400002493
Wang4041_JA-139
DistantMetastasisFree
9.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36959
NA
ClaudinLow
IBD
PID
ICR3
400002494
Wang4621_JA774
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36960
NA
Basal
IBE
PID
ICR2
400002495
Wang4838_JA_696
DistantMetastasis
4.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36961
NA
Her2
IBD
WID
ICR3
400002496
Wang4622_JA777
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36962
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002497
Wang691_JA-70
DistantMetastasisFree
9.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36963
NA
LumB
IBD
WID
ICR4
400002498
Wang4602_JA698
DistantMetastasisFree
5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36964
NA
Her2
IBD
PID
ICR2
400002499
Wang692_JA-71
DistantMetastasis
1
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36965
NA
LumA
IBD
WID
ICR3
400002500
Wang693_JA-71
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36966
NA
Basal
IBE
WID
ICR2
400002501
Wang4050_JA-74
DistantMetastasisFree
7.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36967
NA
Her2
IBD
WID
ICR3
400002502
Wang4051_JA-75
DistantMetastasis
1.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36968
NA
Her2
IBE
PID
ICR1
400002503
Wang4052_JA-78
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36969
NA
Basal
IBE
WID
ICR3
400002504
Wang4053_JA-79
DistantMetastasis
2.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36970
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002505
Wang4856_JA_762@2
DistantMetastasisFree
9.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36971
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002506
Wang4042_JA-140
DistantMetastasis
1.58
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36972
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002507
Wang4568_JA222
DistantMetastasis
3.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36973
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002508
Wang4043_JA-141
DistantMetastasis
2.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36974
NA
LumB
IBE
PID
ICR2
400002509
Wang4547_JA223
DistantMetastasis
1.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36975
NA
Her2
IBD
PID
ICR2
400002510
Wang4863_JA_787@2
DistantMetastasisFree
9.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36976
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002511
Wang4569_JA226
DistantMetastasis
3.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36977
NA
Basal
IBE
PID
ICR3
400002512
Wang4623_JA780
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36978
NA
Normal
IBE
NA
ICR2
400002513
Wang4624_JA782
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36979
NA
LumB
IBE
WID
ICR2
400002514
Wang4901_JA_863
DistantMetastasisFree
8.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36980
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002515
Wang4625_JA783
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36981
NA
Basal
IBE
PID
ICR3
400002516
Wang4902_JA_864
DistantMetastasisFree
7.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36982
NA
Normal
IBE
NA
ICR3
400002517
Wang4903_JA_865
DistantMetastasisFree
7.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36983
NA
LumA
IBD
WID
ICR3
400002518
Wang4605_JA866
DistantMetastasis
6.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36984
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002519
Wang4626_JA785
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36985
NA
LumB
IBE
PID
ICR3
400002520
Wang4904_JA_867
DistantMetastasis
4.58
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36986
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002521
Wang4606_JA868
DistantMetastasis
6.42
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36987
NA
LumA
IBD
PID
ICR3
400002522
Wang4054_JA-80
DistantMetastasisFree
8.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36988
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002523
Wang4627_JA789
DistantMetastasisFree
8
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36989
NA
LumB
IBD
PID
ICR1
400002524
Wang4055_JA-81
DistantMetastasis
0.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36990
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002525
Wang4056_JA-82
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36991
NA
Basal
IBE
WID
ICR3
400002526
Wang4057_JA-84
DistantMetastasisFree
9.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36992
NA
Her2
IBE
WID
ICR3
400002527
Wang4058_JA-86
DistantMetastasisFree
8.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36993
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002528
Wang4059_JA-88
DistantMetastasisFree
8.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36994
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002529
Wang4060_JA-89
DistantMetastasis
0.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36995
NA
Her2
IBE
FID
ICR4
400002530
Wang4894_JA_852@2
DistantMetastasisFree
9.42
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36996
NA
Her2
IBE
WID
ICR4
400002531
Wang4548_JA230
DistantMetastasis
2
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36997
NA
LumB
IBE
PID
ICR1
400002532
Wang4549_JA231
DistantMetastasis
3.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM36998
NA
LumA
IBD
WID
ICR1
400002533
Wang4805_JA_233
DistantMetastasis
0.42
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM36999
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002534
Wang4806_JA_234
DistantMetastasis
3.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37000
NA
LumA
IBD
FID
ICR2
400002535
Wang4862_JA_779@2
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37001
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002536
Wang4550_JA235
DistantMetastasis
2.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37002
NA
Basal
IBE
WID
ICR3
400002537
Wang4807_JA_236
DistantMetastasis
1.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37003
NA
LumB
IBE
PID
ICR2
400002538
Wang4551_JA237
DistantMetastasis
1.58
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37004
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002539
Wang4552_JA239
DistantMetastasis
2.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37005
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002540
Wang4607_JA870
DistantMetastasis
4.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37006
NA
LumB
IBE
PID
ICR2
400002541
Wang4608_JA871
DistantMetastasis
5.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37007
NA
LumB
IBE
PID
ICR2
400002542
Wang4609_JA873
DistantMetastasis
4.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37008
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002543
Wang4610_JA874
DistantMetastasis
5.83
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37009
NA
LumA
IBD
WID
ICR3
400002544
Wang4865_JA_793
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37010
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002545
Wang4866_JA_794
DistantMetastasisFree
8.42
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37011
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002546
Wang4906_JA_876
DistantMetastasis
5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37012
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002547
Wang4867_JA_795
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37013
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002548
Wang4611_JA877
DistantMetastasis
5.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37014
NA
LumB
IBD
WID
ICR3
400002549
Wang4868_JA_796
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37015
NA
LumA
IBD
WID
ICR2
400002550
Wang4629_JA797
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37016
NA
Her2
IBE
PID
ICR3
400002551
Wang4907_JA_879
DistantMetastasisFree
9
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37017
NA
Basal
IBE
WID
ICR3
400002552
Wang4006_JA-90
DistantMetastasisFree
9
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37018
NA
LumB
IBE
PID
ICR1
400002553
Wang4007_JA-91
DistantMetastasis
1.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37019
NA
LumA
IBD
PID
ICR3
400002554
Wang4008_JA-92
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37020
NA
Her2
IBD
PID
ICR2
400002555
Wang4009_JA-93
DistantMetastasis
4
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37021
NA
Basal
IBE
PID
ICR3
400002556
Wang4010_JA-94
DistantMetastasisFree
9.08
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37022
NA
Basal
IBE
FID
ICR3
400002557
Wang4011_JA-96
DistantMetastasis
2.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37023
NA
Her2
IBE
PID
ICR2
400002558
Wang4012_JA-98
DistantMetastasis
1.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37024
NA
LumA
IBD
WID
ICR1
400002559
Wang4899_JA_861@2
DistantMetastasisFree
7.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37025
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002560
Wang4013_JA-99
DistantMetastasisFree
8.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37026
NA
LumA
IBD
WID
ICR3
400002561
Wang4553_JA240
DistantMetastasis
3
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37027
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002562
Wang4554_JA241
DistantMetastasis
1.42
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37028
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002563
Wang4556_JA244
DistantMetastasis
3.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37029
NA
LumB
IBD
PID
ICR1
400002564
Wang4557_JA246
DistantMetastasis
3.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37030
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002565
Wang4558_JA247
DistantMetastasis
3.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37031
NA
LumB
IBE
PID
ICR1
400002566
Wang4808_JA_249
DistantMetastasis
1.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37032
NA
LumA
IBD
FID
ICR3
400002567
Wang4908_JA_883
DistantMetastasisFree
7.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37033
NA
LumA
IBD
WID
ICR4
400002568
Wang4909_JA_887
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37034
NA
Her2
IBE
FID
ICR4
400002569
Wang4895_JA_853@2
DistantMetastasisFree
7.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37035
NA
LumB
IBE
PID
ICR1
400002570
Wang4559_JA250
DistantMetastasis
1.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37036
NA
Her2
IBD
WID
ICR2
400002571
Wang4560_JA252
DistantMetastasis
1.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37037
NA
LumA
IBD
FID
ICR3
400002572
Wang4561_JA253
DistantMetastasis
1.58
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37038
NA
LumB
IBD
PID
ICR2
400002573
Wang4599_JA416
DistantMetastasis
5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37039
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002574
Wang4562_JA254
DistantMetastasis
4
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37040
NA
Basal
IBE
FID
ICR4
400002575
Wang4563_JA255
DistantMetastasis
0.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37041
NA
Normal
IBE
NA
ICR2
400002576
Wang4564_JA258
DistantMetastasis
0.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37042
NA
Her2
IBD
WID
ICR3
400002577
Wang4565_JA259
DistantMetastasis
1.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37043
NA
ClaudinLow
IBD
PID
ICR3
400002578
Wang4910_JA_890
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37044
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002579
Wang4911_JA_891
DistantMetastasisFree
9.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37045
NA
Basal
IBE
WID
ICR4
400002580
Wang4912_JA_894
DistantMetastasisFree
10
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37046
NA
LumA
IBD
FID
ICR3
400002581
Wang4913_JA_899
DistantMetastasisFree
7.17
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37047
NA
Basal
IBE
WID
ICR3
400002582
Wang4620_JA772@R
DistantMetastasisFree
9
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37048
NA
Basal
IBD
PID
ICR1
400002583
Wang4900_JA_862@2
DistantMetastasisFree
7.25
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37049
NA
Her2
IBD
FID
ICR4
400002584
Wang4809_JA_260
DistantMetastasis
2.42
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37050
NA
ClaudinLow
IBD
WID
ICR3
400002585
Wang4570_JA261
DistantMetastasis
1.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37051
NA
ClaudinLow
IBD
FID
ICR3
400002586
Wang4566_JA262
DistantMetastasis
1.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37052
NA
ClaudinLow
IBD
PID
ICR2
400002587
Wang4571_JA263
DistantMetastasis
2.67
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37053
NA
Basal
IBE
PID
ICR1
400002588
Wang4572_JA264
DistantMetastasis
2.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37054
NA
Her2
IBE
PID
ICR2
400002589
Wang4573_JA265
DistantMetastasisFree
5.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37055
NA
Her2
IBD
PID
ICR2
400002590
Wang4574_JA267
DistantMetastasisFree
4.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37056
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002591
Wang4810_JA_268
DistantMetastasisFree
6.83
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37057
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002592
Wang4575_JA270
DistantMetastasisFree
4.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37058
NA
LumB
IBD
WID
ICR2
400002593
Wang4576_JA271
DistantMetastasis
5.33
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasis
GSM37059
NA
LumA
IBD
FID
ICR2
400002594
Wang4577_JA272
DistantMetastasisFree
6.92
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37060
NA
LumA
IBD
PID
ICR2
400002595
Wang4578_JA273
DistantMetastasisFree
6.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37061
NA
LumA
IBD
PID
ICR1
400002596
Wang4579_JA275
DistantMetastasisFree
8.75
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree
GSM37062
NA
LumB
IBE
PID
ICR2
400002597
Wang4811_JA_276
DistantMetastasisFree
4.5
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
NA
BoneMetastasisFree

Group Sets View in Gene Expression Browser

Name  
All Samples Default  View
Immune Benefit Status   View
Immunological Constant of Rejection   View
Molecular Subtype   View
In order to make new Group Sets or change settings, please log in.

Module Analysis

Group Set  
All Samples
Immune Benefit Status
Immunological Constant of Rejection
Molecular Subtype
Your bug report has been sent!